Plusieurs organisations intergouvernementales traitent également de la question de la facilitation des échanges. Elles:
- élaborent et administrent des conventions et des Accords internationaux portant sur ce sujet;
- élaborent des normes, des recommandations, des directives et autres instruments pertinents;
- fournissent une assistance technique et un renforcement des capacités appropriés aux pays en développement et aux économies en transition;
- servent de forum de discussion sur les questions relatives à la facilitation des échanges.